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iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，进行LC-MS...

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关键词：蛋白质组定量蛋白质组 iTRAQ

iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技术是一种多肽体外标记技术。该技术采用4-plex或8-plex同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，进行LC-MS/MS分析，可同时比较多种不同样本中蛋白质的相对表达含量。

实验流程：

*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析，对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断。

应用方向：

生物领域各个研究方面，如：

◆ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

◆ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

◆ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

◆ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等。

技术优势：

◆ 具有2-8 plex标签，可同时标记2-8组样本进行表达差异分析；

◆ 是一种体外标记技术，可标记动物、植物、微生物、临床、体液或细胞等多种样本；

◆ 不同标签混合后上机，具有较好的平行性，避免技术误差，提高检测效率；

◆ 与凝胶方法相比，iTRAQ可发现膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白、强碱和强酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白质，对低丰度蛋白质亦有较好的检出率。

数据分析：

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析内容
WGCNA共表达分析	获得与表型强关联的核心蛋白质
趋势聚类分析	探讨蛋白质的表达趋势模式