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4D-泛素化修饰蛋白质组学

蛋白泛素化修饰（Ubiquitination）常伴随泛素-蛋白酶体降解，引起蛋白稳定性变化，参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应，使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸（Lys）侧...

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关键词：翻译后修饰组修饰蛋白定量分析 4D-泛素化

蛋白泛素化修饰（Ubiquitination）常伴随泛素-蛋白酶体降解，引起蛋白稳定性变化，参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应，使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸（Lys）侧链上，并常伴随蛋白酶体降解，调控蛋白表达水平变化。发生泛素化修饰的赖氨酸共价连接泛素分子，即两个甘氨酸K-ε-GG残基，使分子量产生114.1 Da的质量偏移。利用质谱可精确测定分子量是否发生114.1Da的质量偏移，从而检测泛素化修饰肽段及位点。 4D-label free泛素化蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行泛素化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程：

应用方向：

◆ 药理药靶、基因敲除/过表达的修饰表达分析；

◆ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究；

◆ 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路；

◆ 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析；

◆ 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究；

◆ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。

推荐组合产品：蛋白表达水平全面解析：转录组+蛋白组+泛素化组。

技术优势：

◆ 4D技术加持，提高定量的准确性、鉴定深度，更加适合微量样本；

◆ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便；

◆ 前沿技术——基于新一代质谱平台（Bruker timsTOF pro），检测速度提升近一倍；

◆ 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验，拥有数量与质量领先的高水平项目文章；

◆ 数据保证——采用进口金标抗体，高标准修饰富集操作，数据结果稳定可靠；

◆ 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析，实现快捷”一站式”服务。

推荐组合产品：蛋白表达水平全面解析：转录组+蛋白组+泛素化组。

数据分析：

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析内容
WGCNA共表达分析	获得与表型强关联的核心蛋白质
趋势聚类分析	探讨蛋白质的表达趋势模式