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4D-琥珀酰化修饰蛋白质组学

蛋白质琥珀酰化（Succinylation）修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式，是通过酶活性催化和非酶活性催化两种方式，将琥珀酰基供体上的琥珀酰基团结合到蛋白质赖氨酸残基的过程。发生酰化修饰的氨基酸上可共价连接琥珀酰，其分子质量会相应增加1...

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关键词：翻译后修饰组修饰蛋白定量分析 4D-琥珀酰化

蛋白质琥珀酰化（Succinylation）修饰是一种新型蛋白质翻译后修饰方式，是通过酶活性催化和非酶活性催化两种方式，将琥珀酰基供体上的琥珀酰基团结合到蛋白质赖氨酸残基的过程。发生酰化修饰的氨基酸上可共价连接琥珀酰，其分子质量会相应增加100.01Da。质谱能够精确地测定分子量是否发生相应的质量偏移，实现酰化修饰肽段及位点的分析。赖氨酸琥珀酰化修饰能够引起蛋白质较大的质量变化（100.01 Da），且赖氨酸琥珀酰化修饰能诱导电荷突变（+1至－1），因此赖氨酸琥珀酰化修饰能够产生更大的结构变化和电荷变化，在调控蛋白质结构和核心能量代谢功能（包括三羧酸循环、糖代谢等）方面发挥着重要作用，对线粒体失调、代谢紊乱相关疾病的研究具有重要价值。 4D-label free琥珀酰化修饰蛋白组学是基于新一代timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行琥珀酰化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

实验流程：

应用方向：

◆ 代谢调控：代谢疾病、代谢紊乱等；

◆ 药理药靶、基因敲除/过表达的修饰表达分析；

◆ 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究；

◆ 细胞自噬、细胞周期、衰老等信号通路；

◆ 神经及退行性疾病、肿瘤发病机制等机制研究；

◆ 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选。

技术优势：

◆ 4D技术加持，提高定量的准确性、鉴定深度，更加适合微量样本；

◆ 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便；

◆ 前沿技术——基于新一代质谱平台（Bruker timsTOF pro），检测速度提升近一倍；

◆ 经验丰富——超16年蛋白平台服务经验，拥有数量与质量领先的高水平项目文章；

◆ 数据保证——采用进口金标抗体，高标准修饰富集操作，数据结果稳定可靠；

◆ 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析，实现快捷”一站式”服务。

数据分析：

标准数据分析内容
蛋白质总鉴定数量分析	蛋白鉴定与定量结果统计、韦恩图分析、差异结果数量统计、火山图、聚类热图
差异蛋白质功能分析	亚细胞定位、结构域分析、motif分析、GO功能分析、KEGG通路分析、互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析内容
WGCNA共表达分析	获得与表型强关联的核心蛋白质
趋势聚类分析	探讨蛋白质的表达趋势模式